외계인 카리마 일행은 독도 바다 아래의 해저 도시에 있는, 엄청난 파괴력을 가진 돌을 이용, 지구를 정복하려 한다. 천재소년 똘이는, 신비의 돌이 가진 세가지 수수께끼의 열쇠를 우주평화를 지키려는 외계인 아리안 일행으로부터 제공받아 지구를 수호하려 한다.그러나 용의 주도한 카리마의 덫에 걸려 모두 사로 잡히게 된다.그들을 위기로부터 구할 수 있는 돌의 세번째 비밀을 알아내기 위해 김박사에게 은밀히 보냈던 로보트마저 카리마에 의해 파괴당하자, 똘이 일행은 절대 절명의 순간을 맞는다. 그러나 돌의 세번째 비밀은 바로 악의 징계로서, 마침내 돌의 무서운 파괴력에 의해 카리마 일행은 섬멸된다.